Con el objetivo de ser más amable con el medio ambiente, el sector hotelero de Puerto Vallarta ha implementado diversas prácticas sustentables enfocadas a reducir la huella de carbono, así como la protección de la flora y fauna que se tienen en el destino, así lo dio a conocer el Fideicomiso Público para la Promoción y Publicidad Turística de esta ciudad. Dio a conocer que algunos han adoptado sistemas de energía solar a fin de reducir significativamente la huella de carbono, mientras que otros implementaron plantas de tratamiento de aguas residuales, que son aprovechadas para regar los jardines de los hoteles. El fidetur también señaló que la zona hotelera sur de la ciudad cuenta con una serie de hoteles boutique que promueven la sustentabilidad, propuestas únicas de alojamiento y que permiten que los huéspedes se desconecten del ajetreo de la ciudad. Una de las iniciativas más destacadas de la región es la conservación de tortugas marinas, en donde algunas empresas organizan actividades donde huéspedes y locales se unen para proteger los nidos y liberar las crías, poniendo su granito de arena para evitar la extinción de dicha especie y creando un sentido de comunidad. Asimismo el fideicomiso señaló que las certificaciones Blue Flag son otro aspecto relevante en el que algunos hoteles han estado trabajando, lo que permite tener playas y marinas con altos estándares de calidad de agua, gestión y educación ambiental para preservar de manera sostenible dichos espacios, además de contar con un estricto control de verificación y seguimiento de estos.